IHES (Integrated and Holistic Education System), Quranic Generation Development Program, LTQ (Lembaga Tahfidz Quran) with the method of Qiroati and Tahfidz Class, literasi & numerasi intensif.
Sebagai satu-satunya Sekolah Dasar di Bekasi yang memiliki izin akselerasi, Integrated Islamic School Gema Nurani adalah sekolah yang menerapkan sistem Program Pengembangan Generasi Alquran. Sebuah sistem yang didasarkan pada Al-Qur’an dan Sebagai Sunnah untuk membedakan karakter siswa untuk membentuk pola pikir siswa untuk mengasihi Tuhan, Islam, dan Sunnah.
Alur seleksi masuk SDIT yaitu tes calistung dasar dan baca Qur'an.